Органное музицирование в Московском университете имеет давние традиции. Первый орган был установлен в Университете в 1804 году - это был подарок от П.Г. Демидова. Звуки органа украшали празднование знаменательных событий, исполнителями были студенты университета. К сожалению, во время пожара 1812 года инструмент спасти не удалось.

Вспомнили об органных традициях уже только после Великой Отечественной войны, во время ректорства И.Г. Петровского. Университет вел переговоры об установке духового органа в новом здании МГУ с одной из чешских органостроительных фирм, однако они зашли в тупик. Нынешний Органный класс МГУ был создан в 1981 году Йозефом Штиглером, эмигрировавшим в СССР в конце 70-х годов чешским органистом, учеником Б. Голуба, Б. Видерманна и И. Рейнбергера. Тогда же для нужд класса были куплены два электронных органа "Прелюдия-2" Рижской фабрики электромузыкальных инструментов. С 1989 года Органный класс возглавляет выпускница Нижегородской консерватории Юлия Лотова, она заново собрала коллектив, распавшийся после ухода Штиглера, привела в порядок неисправные инструменты, по ее инициативе при финансовой поддержке тогдашнего Директора Дома культуры МГУ В.Д. Гаврикова была создана нотная библиотека, включающая основной органный репертуар.

За время существования Органного класса к серьезной классической музыке приобщился не один десяток студентов и аспирантов МГУ, многие из них успешно продолжают научную карьеру, некоторые приобрели известность в музыкальном мире. Было сыграно множество концертов как в МГУ, так и в других залах Москвы, России и за рубежом. Профессиональные музыканты отмечают высокий уровень исполнения и интересную музыкальную концепцию, которой придерживается коллектив. В репертуаре Органного класса произведения разных стилей и эпох. Значительное внимание уделяется ансамблевой музыке, когда в сопровождении органа звучат скрипка, виолончель, флейта, вокал. Благодаря органному классу стали возможны совместные с Театром Старинной музыки монументальные постановки, включающие фрагменты из "Высокой" мессы, "Страстей" И.С.Баха, из оратории "Мессия" Г.Ф.Генделя, редко исполняемые сочинения А.Т.Гречанинова.

К сожалению, с осени 2005 года деятеятельность Органного класса сводится, в основном, к репетиционной работе, использовать в качестве концертного инструмента единственный исправный старый орган невозможно из-за его аварийного технического состояния и плохого качества звука. Тем не менее, коллектив существует, пополняется новыми участниками, расширяет репертуар. Участники Органного класса надеятся, что в юбилейный для Московского университета год руководством МГУ будет принято решение о приобретении нового цифрового инструмента, и тогда торжественные звуки органа, как и двести лет назад, украсят любое празднование в стенах Московского университета.